Peugeot Boxer II byl poprvé představen v roce 2006. Ve stejném roce začala rovněž jeho masová výroba v Itálii a Mexiku. Nový dodávkový vůz Peugeot získal ještě aerodynamičtější tvar, díky kterému bylo možné snížit koeficient odporu vzduchu o několik dalších procent (Cx = 0,31). Peugeot Boxer II měl kombinovat užitečnou hmotnost a všestrannost dodávky s komfortem osobního automobilu. V důsledku toho byla rozšířena škála dostupných verzí karoserie a byla provedena určitá zlepšení v kabině řidiče.
Druhá generace Peugeot Boxer přinesla rovněž stylistické změny. Maska byla výrazně oddělena od nárazníku a vytvořila charakteristický práh. Majitelé a nadšenci tohoto modelu si správně všimli, že dodávka působí dojmem natahování svalů. V srdci nárazníku byla umístěna plastová ozdoba ve tvaru mřížky. Kapota zůstala na obou stranách obalena světly v novém designu. Výrazná změna se dotknula rovněž bočních zrcátek, do kterých byly umístěna směrová světla. Výrobce je rovněž nabízel ve verzích se snímačem venkovní teploty v jednom ze zrcátek. V zadní části vozidla se objevily modernější zadní světla umístěná na zadních sloupcích. Nákladní verze měla ještě více nákladového prostoru a nabízela 6 variant od 8 do 17 m3 a nosnost (4 verze) se pohybovala od 1 do 2 tun. U verze pro cestující byl k dispozici kromě 8-místného kombi rovněž 15-místný minibus.
Francouzský výrobce automobilů se zcela vzdal benzínových motorů. Provedené analýzy ukázaly, že se pro benzínové jednotky v dodávkových vozech rozhoduje několikrát méně zákazníků než pro vznětové motory. Proto je evropská verze vozidla do dnešního dne v prodeji k dispozici pouze s motory poháněnými motorovou naftou. Ve druhé generaci Boxera se vyskytovaly dva typy manuálních převodovek – pětistupňové a šestistupňové, které přenášely výkon přímo na přední nápravu.
V kabině Peugeota Boxer II byly provedeny úpravy, které měly za úkol, aby se co nejvíce podobal osobnímu automobilu. Výrobce samozřejmě nezapomněl přidat i několik kapes a přihrádek, které zintenzívnily prostorový potenciál dodávky. Nová verze byla navržena tak, aby umožňovala instalaci dalšího vybavení – automatické klimatizace, audio systém s hands-free sadou nebo satelitní GPS navigaci. V průběhu let a vývoje technologie byla do dodávek postupně implementována následná řešení používaná v osobních automobilech.
V roce 2014, 8 let po premiéře, přišel čas na facelift Peugeota Boxer II. Pro některé byly změny tak velké, že tuto verzi nazývají třetí generací dodávky. Nejedná se však o profesionální pojmenování, protože výrobce jasně uvedl, že se jedná pouze o facelift. Hlavní změnou bylo přemodelování předního pásu, který zapadl do panujícího stylu modelů francouzské značky. Byl to právě design, který měl přitáhnou k Boxeru osoby zajímající se o dodávku. Další změny se týkaly možností konfigurace. Zadní část vozidla byla díky použití pneumatického odpružení snížena o 7 centimetrů. Největší z nabízených modelů má celkovou hmotnost 4 tuny, zatímco verze pro přepravu osob nabízí 8 míst. Pod kapotou se znovu objevily 2 dieselové jednotky se stejnou kapacitou jako v dřívějších modelech. Tentokrát byl však menší motor k dispozici ve třech výkonových variantách - 110, 130 nebo 150 HP. Větší jednotka generuje 180 HP. V osvěžených verzích byly zavedeny nové světlomety s denními světly s technologií LED. Pro zajištění optimálního pohodlí pro řidiče a cestující byla sedadla nahrazena zcela novou generací. Z užitečných změn je nutné rovněž zmínit místo na nápoje spojený s konsolou a držák na mobilní zařízení a notebooky.
